Issue |
Fruits
Volume 60, Number 2, March-April 2005
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Page(s) | 143 - 153 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/fruits:2005018 | |
Published online | 15 July 2005 |
Tunisian fig (Ficus carica L.) genetic diversity and cultivar characterization using microsatellite markers
1
Laboratoire de Génétique moléculaire, immunologie et biotechnologie, Faculté des Sciences de Tunis, Campus universitaire, 2092 El Manar Tunis, Tunisia
2
École supérieure d’Horticulture et d’élevage, 4042 Chott Mariem, Sousse, Tunisia
3
IPGRI, Centre de Recherches phoénicicoles (CRPh), Degache, Tunisia
Corresponding author: Mokhtar.T@fst.rnu.tn
Received:
26
July
2004
Accepted:
4
January
2005
Introduction. Ficus carica L., well adapted to the Mediterranean climate, is ubiquitous in Tunisia. In spite of the large possibilities of its adaptation to the Tunisian climate, its cultivation remains traditional. In Tunisia, this species is represented by a large number of varieties which are facing genetic erosion. To save these genetic resources, we studied some of the Tunisian varieties using molecular markers. The aim of this analysis was to study the genetic diversity of some cultivars and to characterize them. Materials and methods. Six microsatellites were used to characterize 16 cultivars (Ficus carica L.) belonging to two fig tree collections in the south of Tunisia. Results. The molecular markers used appeared highly polymorphic in common fig trees since 4–12 alleles per locus and a mean of heterozygoty of 0.656 were scored. The resolving power (Rp) of the six microsatellites tested ranged from 2.12 to 3.87 for the 16 cultivars studied, showing a significant genetic diversity (Ht = 0.762). Genetic differentiation between geographical groups was low (Gst = 0.032). The factorial correspondence analysis showed no well-defined relation between the 16 cultivars and their geographical origin. The genotype patterns allowed us to discriminate all of the cultivars. Conclusion. The characterization of the accessions belonging to different varieties was possible, showing the power and efficiency of the molecular tools used.
Résumé
Introduction. Ficus carica L., bien adapté au climat méditerranéen, est omniprésent en Tunisie. Malgré ses grandes possibilités d’adaptation au climat tunisien, sa culture demeure traditionnelle. En Tunisie, cette espèce est représentée par un grand nombre de variétés qui sont exposées à l'érosion génétique. Afin de préserver ces ressources génétiques, nous avons étudié certaines variétés tunisiennes en utilisant des marqueurs moléculaires. Le but de ces analyses a été d’étudier la diversité génétique et de caractériser ces cultivars. Matériel et méthodes. Six microsatellites ont été utilisés afin de caractériser 16 cultivars de figuiers appartenant à deux collections du sud tunisien. Résultats. Les marqueurs moléculaires utilisés se sont révélés hautement polymorphes chez le figuier commun, puisque 4 à 12 allèles par locus et une hétérozygotie moyenne de 0,656 ont été enregistrés. Le pouvoir de résolution (Rp) des six microsatellites testés a varié de 2,12 à 3,87 pour les 16 cultivars étudiés qui ont montré une importante diversité génétique totale (Ht = 0,762). La différenciation génétique entre collections a été faible (< 5 %) (Gst = 0,032). L’analyse factorielle des correspondances n’a pas mis en évidence de relations entre les cultivars et leur origine géographique. Les profils génotypiques ont permis de discriminer la totalité des cultivars. Conclusion. La caractérisation des accessions appartenant à différentes variétés de figuiers a été possible ce qui témoigne de la puissance et de l’efficacité des outils moléculaires utilisés.
Key words: Tunisia / Ficus carica / genetic resources / identification / microsatellites / genetic markers
Mots clés : Tunisie / Ficus carica / ressource génétique / identification / microsatellite / marqueur génétique
© CIRAD, EDP Sciences