Original article

Antagonistic bacteria with potential for biocontrol on Rhizopus stolonifer obtained from blackberry fruits

Bactéries antagonistes ayant un potentiel de lutte biologique contre Rhizopus stolonifer obtenu à partir des fruits du mûrier.

Bacterias antagonistas con potencial de biocontrol contra Rhizopus stolonifer obtenido de frutos de zarzamora.

¹ Dep. Biotecnol., Cent. Interdiscip. Investig. Desarro. Integral Reg. Unidad Michoacán, Inst. Politéc. Ntl., Justo Sierra N0. 28 Col. Cent., C.P. 59510 Jiquilpan Michoacán México
² Dep. Interacciones Planta-Insecto, Cent. Desarro. Prod. Biót., Inst. Politéc. Ntl., Carret. Yautepec-Jojutla, Km. 6, Calle CEPROBI No. 8, Col. San Isidro, C.P 62731, Apartado Post. 24, Yautepec, Morelos, México ,
anhernandez@ipn.mx, aniurka10@hotmail.com

^* Correspondence and reprints

Received: 30 January 2013
Accepted: 29 May 2013

Abstract

Introduction. México is one of the most important producers and exporters of blackberries in the world. During postharvest handling, blackberry fruits are exposed to the attack of phytopathogenic fungi. Materials and methods. To obtain Rhizopus stolonifer isolates, samples of leaves and rhizospheric soils were placed on Petri plates containing Potato Dextrose Agar (PDA). In addition, fruits were also placed in humidity chambers at 25 °C. To describe the infection process on blackberry fruits by Rhizopus stolonifer, samples were taken at different intervals for a period of 72 h. All fungal isolates obtained were maintained on PDA. The bacterial colonies were isolated and purified by streaking on PDA. The antagonistic activity of the bacteria was assessed against R. stolonifer by dual culture technique on PDA. To detect the production of siderophores, the chrome azurol S assay was carried out. Results. The infection process of R. stolonifer on blackberry fruits was described for the first time in this work. Eighty-six bacterial isolates from different parts of the plant and rhizospheric soil were obtained. Bacterial isolates with antagonistic activity were identified and the production of siderophores was measured. Four isolates showed antagonistic activity against R. stolonifer. Bacillus subtilis obtained from soil was the most effective isolate. Conclusion. In this study we isolated and identified antagonistic bacteria with potential for biocontrol on Rhizopus stolonifer obtained from blackberry fruits. To our knowledge this is the first report regarding this topic.

Résumé

Introduction. Le Mexique est l’un des plus importants producteurs et exportateurs de mûres dans le monde. Au cours de la manutention post-récolte, ces fruits sont exposés à l’attaque de champignons phytopathogènes. Matériel et méthodes. Pour obtenir des isolats de Rhizopus stolonifer, des échantillons de feuilles et de rhizosphère ont été placés en boîtes de Pétri contenant un milieu PDA (Potato Dextrose Agar). En outre, des fruits ont également été placés dans des chambres humides à 25 °C. Pour décrire le processus d’infection des mûres par R. stolonifer, des échantillons ont été prélevés à des intervalles différents pendant une période de 72 h. Tous les isolats fongiques obtenus ont été maintenus sur milieu PDA. D’autre part, les colonies bactériennes ont été isolées et purifiées par stries sur le milieu PDA. L’activité antagoniste des bactéries contre R. stolonifer a été évaluée par la technique de double culture sur PDA. Pour détecter la production de sidérophores, un dosage à l’azurol de chrome a été effectué. Résultats. Le processus d’infection des mûres par R. stolonifer a été décrit pour la première fois dans ce travail. Quatre-vingt-seize isolats bactériens provenant de différentes parties de la plante et de la rhizosphère du sol ont été obtenus. Les isolats bactériens ayant une activité antagoniste ont été identifiés et la production de sidérophores a été mesurée. Quatre isolats ont montré une activité antagoniste contre R. stolonifer. Bacillus subtilis isolé à partir du sol a été l’isolat le plus efficace. Conclusion. Dans notre étude, nous avons isolé et identifié des bactéries antagonistes ayant un potentiel de lutte biologique contre R. stolonifer obtenu à partir mûres. À notre connaissance, il s’agit du premier rapport sur le sujet.

Resumen

Introducción. México es uno de los productores y exportadores más importantes de zarzamoras del mundo. Durante el manejo postcosecha, los frutos de zarzamora están expuestos al ataque de hongos fitopatógenos. Material y métodos. Para obtener aislados de Rhizopus stolonifer, muestras de hojas y de suelo rizosférico fueron colocados en cajas Petri conteniendo Papa Dextrosa Agar (PDA). Además, los frutos también fueron colocados en cámaras húmedas a 25 °C. Para describir el proceso de infección de Rhizopus stolonifer en frutos de zarzamora, se tomaron muestras a diferentes intervalos por un periodo de 72 h. Todos los aislados fúngicos obtenidos fueron mantenidos en PDA. Por otra parte, las colonias bacterianas se aislaron y purificaron estriando en PDA. La actividad antagonista de las bacterias contra R. stolonifer fue evaluada mediante la técnica de cultivo dual en PDA. Para detectar la producción de sideróforos, se realizó el ensayo de cromo azurol. Resultados. El proceso de infección de R. stolonifer en frutos de zarzamora fue descrito por primera vez en este trabajo. Se obtuvieron 86 aislamientos bacterianos de diferentes partes de la planta y de suelo rizosférico. Los aislados bacterianos con actividad antagonista fueron identificados y la producción de sideróforos fue medida. Cuatro aislados mostraron actividad antagonista contra R. stolonifer. Bacillus subtilis obtenido de suelo fue el aislado más efectivo. Conclusión. En este estudio aislamos e identificamos bacterias antagonistas con potencial de biocontrol sobre Rhizopus stolonifer obtenido de frutos de zarzamora. Para nuestro conocimiento este es el primer reporte en este tema.